ซิมโฟเกียร์ หลังจากจบภาคแรกเป็นเวลา 3 เดือน ญี่ปุ่นร่วมมือกับอเมริกาเพื่อค้นคว้าวิจัยระบบของ Symphogear ให้ลึกยิ่งขึ้น วัตถุโบราณที่สมบูรณ์แบบชิ้นใหม่ ภายใต้ชื่อ Sacrist S ได้ถูกส่งมาที่ฐานทหารในประเทศอเมริกา ปรากฏศัตรูที่ซ่อนตัวในเงามืด และพวก Noise ที่หลงเหลือจากบอสภาคแรก ฟิเน่ (Fine) ก็ได้ปรากฏตัวขึ้น ทำให้ฮิบิกิ, ซึบาสะ และคริส ต้องใช้ Symphogear เพื่อต่อสู้กับพวก Noise เหล่านั้นอีกครั้ง